Com o intuito de contribuir para o acesso e a permanência dos alunos nas escolas de áreas rurais do município, a Prefeitura de Itaboraí, por meio da Secretaria Municipal de Educação (SEMED), oferece o transporte escolar gratuito para quase 3 mil alunos matriculados na rede municipal de ensino e que estudam em escolas da zona rural. Ao todo, 42 ônibus atuam neste serviço, realizado pelo Setor de Transporte Escolar, da Subsecretaria de Material, Patrimônio e Transporte da SEMED.
O transporte escolar atende 42 escolas municipais, tanto para alunos da área rural quanto para estudantes com necessidades especiais, da Educação Infantil à Educação de Jovens e Adultos (EJA), nos horários da manhã, tarde e noite, incluindo o período integral. Dentre as localidades atendidas, estão: Sambaetiba, São José, Agro Brasil, Sapê, Picos, Penedo, Alto do Jacu, Morada do Sol, Muriqui, Cabuçu, Perobas, Pacheco e Curuzu. Além do Centro, Manilha, Itambi, Areal, Ampliação, Gebara, Visconde, Porto das Caixas, Vila Gabriela, Joaquim de Oliveira, Bela Vista, Marambaia e Apolo.
Os ônibus escolares atuam ainda em atividades extraclasse para todos os alunos da rede municipal de ensino, como passeios, eventos educativos e outros. Ao todo, 72 motoristas atuam no transporte escolar, divididos por turnos, além de 36 monitores, que são responsáveis pela organização e convivência dos alunos que são transportados, auxiliando ainda no embarque e desembarque. Os veículos variam de 11 a 60 lugares sentados.
